関東圏内にお住みの仮定で、少しお話しさせていただきます。

目標の大学が文系難関私大であれば、おそらく附属高校があるかと思います。
附属高校の試験は往往にして３科目なので、理社を捨て科目にして、３科目受験でその附属高校に合格するのが一番の近道と言えます。

もし、その附属高校の偏差値に及ばないのであれば、目標大学を変えるのも一つの手です。難関私大と言えど、大学受験をするより高校受験で付属高校から入学する方が圧倒的に楽です。附属高校にすら合格する実力がない以上、大学受験でその私立大学に合格するのはかなり難しいでしょう。

結論として、附属高校を受けるのであれば、理科と社会を捨て科目にしても大丈夫です。しかし附属高校を受けないのであれば、やはり大学受験のことを考えると、少々危険でしょう。大学受験の文系私大の入試では、社会はほぼ必須の科目です。

また、3科目受験の高校も附属高校でないのでしたら、正直授業レベルもそれほど期待できるものではありません。独学でその後の受験勉強をしたとしても、やはり5科目受験の高校の方をオススメいたします。